U Nišu zbog pruge koja prolazi kroz grad bezbednost je višestruko ugrožena. Na teritoriji železničkog čvora Niš ima 40 putnih prelaza, svi su obezbeđeni, ali 24 imaju rampe, a 14 ne. Godinama u nazad najavljivano je izmeštanje pruge iz grada. Izmeštanje pruge, iako omiljena tema mnogih vlasti, do sada se svodila samo na potpisivanje raznih dokumenata. Godine 2010. potpisan je Protokol o saradnji grada i Železnica Srbije, a tada je rečeno da će se izmeštanje finansirati Evropska unija.
Međutim protokol o trošenju milion i po evra za izradu projektne dokumentacije potpisan je tek prošle godine, a struka je trebalo ove godine da da konačno rešenje. Izgradnju železničke obilaznice trebalo je da prati i elektifikacija pruge Niš-Dimitrovgrad.
